元帳マスクで@translate関数を使用しており、業務責任単位ごとに変換テーブルのカスタム表を作成して入力の制御を試みましたが、デフォルト表に従って入力が制御されてしまいます。

デフォルト表が適用される仕様となります。

元帳マスクは、どの業務責任単位であれ入力が不適切なデータ範囲を保護するためのものです。そのため、業務責任単位依存の情報（カスタム表）は参照されず、デフォルト表が適用されます。

業務責任単位ごとに変換テーブルのカスタム表を使って入力を制御したい場合は、以下のいずれかをご検討ください。いずれも @translate 関数でカスタム表を参照できます。